A Comissão de Pós-Graduação compete, além de outras normas e critérios estabelecidos pelo Conselho de Pós-Graduação - CoPGr, traçar as diretrizes e zelar pela execução dos Programas de Pós-Graduação e Coordenar as atividades didático-científicas pertinentes aos seus Programas.

Assim, a EEL- USP oferece os seguintes Programas de Pós-Graduação stricto-sensu:

Sediado no Departamento de Engenharia de Materiais da Escola de Engenharia de Lorena (EEL) da Universidade de São Paulo (USP), o Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Materiais (PPGEM) é um programa de excelência em pós-graduação stricto-sensu (mestrado e doutorado) em Engenharia de Materiais

O Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Industrial visa formar recursos humanos qualificados nos níveis de mestrado e doutorado. Os profissionais formados estão habilitados para atuar nas universidades, nos centros de pesquisa e no setor empresarial que emprega processos biotecnológicos.

O Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química (PPG-EQ) é um dos programas de pós-graduação da Escola de Engenharia de Lorena (EEL / USP), e tem como finalidade habilitar profissionais de nível superior em atividades de pesquisa e de docência no campo da Engenharia Química e na área de concentração “Desenvolvimento de Produtos e Processos”.

O Programa de Mestrado Profissional em Projetos Educacionais de Ciências PPGPE/EEL-USP constitui-se como uma modalidade de formação profissional e continuada voltada aos profissionais de Ensino. Trata-se de uma modalidade de formação em nível de pós-graduação stricto sensu, composta por estudos, trabalhos e atividades de pesquisa aplicadas à prática profissional abertos a candidatos diplomados em cursos superiores de graduação e que atendam às exigências das instituições de ensino e ao edital de seleção dos alunos (Art. 44, III, Lei nº 9.394/1996).

O Programa de Pós-Graduação em Meio Ambiente e Desenvolvimento é um programa de pós-graduação stricto-sensu inovador e interdisciplinar, dedicado à formação de mestres altamente qualificados. Com o foco no Desenvolvimento Sustentável, o programa oferece um ambiente acadêmico de excelência, preparando profissionais capazes de enfrentar os desafios contemporâneos e contribuir significativamente para o progresso da sociedade.